Криза без преседана, узрокована пандемијом вируса COVID-19, која је током године погодила цео свет, донела је неизвесност у многим аспектима живота, а поготово у сектору ваздушног саобраћаја, који се у периоду од марта до јуна 2020. године суочио са падом броја летова од око 90%. Са избијањем пандемије, почело је и затварање међународних аеродрома широм Европе и затварање граница, приземљење авио компанија, као и ограничавање и укидање путовања уопште. У ваздушном простору надлежности SMATSA доо, у првих девет месеци 2020. године, забележен је пад броја летова од 56% у односу на исти период претходне године. И даље није могуће са прецизношћу предвидети период опоравка ваздушног саобраћаја, односно тренутак када ће се број летова вратити на ниво од пре пандемије, иако постоје предвиђања одређених институција као ACI, IATA, ICAO, Eurocontrol. Очекује се да ће опоравак бити спор и да ће зависити од много фактора који се у овом тренутку не могу са прецизношћу проценити, као што су: укидање рестрикција и отварање граница држава, промене у понуди (капацитет авио превозилаца, евентуална банкротирања, смањења флоте, итд.)  и потражњи (повећан страх од летења и заражавања, смањење бизнис путовања, итд), социо-економски фактори, куповна моћ, могућа рецесија. Углавном се процењује да ће се број летова из 2019. године моћи достићи тек у периоду између 2023. и 2025. године. И у условима смањеног обима саобраћаја, SMATSA доо наставља да пружа услуге безбедно, редовно и експедитивно, свим учесницима у ваздушном саобраћају.