SMATSA doo je posvećena dostizanju i održavanju visokog nivoa obezbeđivanja u okviru svih poslovnih aktivnosti i realizuje se kroz razvoj i primenu sistema upravljanja obezbeđivanjem u vazduhoplovstvu (Security Management System, SeMS), koji je deo integrisanog menadžment sistema kompanije, a kojim se postiže zaštita infrastrukture, objekata i sistema, osoblja, operativnih podataka i komunikacionih tehnologija od radnji nezakonitog ometanja.
Mere obezbeđivanja u vazduhoplovstvu u SMATSA doo sprovode se u skladu sa domaćim zakonima, podzakonskim aktima država osnivača i Nacionalnim programom za obezbeđivanje u vazduhoplovstvu Republike Srbije i Nacionalnim programom bezbjednsti vazdušnog saobraćaja Crne Gore, kao i standardima obezbeđivanja Međunarodne organizacije civilnog vazduhoplovstva (ICAO), Evropske konferencija civilnog vazduhoplovstva (ECAC) i Evropske unije.
U SMATSA doo obezbeđivanje u vazduhoplovstvu uključuje sve zaposlene i u cilju razvoja kulture obezbeđivanja u vazduhoplovstvu zaposlenima se redovno dostavljaju informacije u vezi sa obezbeđivanjem i organizuju se obuke za zaposlene u skladu sa zaduženjima, a zaposleni se ohrabruju i motivišu za dostavljanje povratnih informacija u vezi sa obezbeđivanjem u vazduhoplovstvu.